全基因组测序
2018-04-11
肿瘤样本全基因组测序(推荐50乘深度)
肿瘤样本全基因组测序(推荐50乘深度)
文库类型: ~ 350bp 插入片段
测序策略: Illumina PE150 测序
测序深度: 150G raw data
1. 数据质控:去除接头污染和低质量数据
2. 与参考序列进行比对、统计测序深度及覆盖度
3. Somatic SNV/InDel/SV/CNV 检测、注释及统计(成对样本)
A+ 分析
基本信息分析 基础上增加 5 项分析:
1. 易感基因筛查
2. 高频突变基因统计及通路富集分析
3. NMF 突变特征及突变频谱分析
4. NovoDriver 已知驱动基因筛选
5. 基因组变异 Circos 图展示
启动子活性检测
下载1:启动子活性检测介绍
下载2:启动子活性检测合同模板